Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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DEFA4P12838 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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DEFA4P12838 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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DEFA4P12838 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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