Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms