Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF1P09603 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms