Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPM2P07951 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TPM2P07951 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TPM2P07951 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPM2P07951 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPM2P07951 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPM2P07951 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms