Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDHBP07195 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDHBP07195 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDHBP07195 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDHBP07195 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDHBP07195 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDHBP07195 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDHBP07195 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDHBP07195 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDHBP07195 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDHBP07195 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDHBP07195 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDHBP07195 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDHBP07195 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDHBP07195 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDHBP07195 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDHBP07195 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDHBP07195 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDHBP07195 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDHBP07195 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms