Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms