Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms