Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL41O60662 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms