Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSNA1O43805 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms