Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAB2O43741 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAB2O43741 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms