Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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