Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPATO15228 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPATO15228 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPATO15228 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPATO15228 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPATO15228 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPATO15228 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPATO15228 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPATO15228 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPATO15228 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPATO15228 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPATO15228 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPATO15228 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPATO15228 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPATO15228 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPATO15228 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPATO15228 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPATO15228 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPATO15228 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPATO15228 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPATO15228 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPATO15228 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPATO15228 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPATO15228 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPATO15228 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPATO15228 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPATO15228 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPATO15228 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPATO15228 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPATO15228 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPATO15228 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPATO15228 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPATO15228 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPATO15228 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPATO15228 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPATO15228 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPATO15228 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPATO15228 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
GNPATO15228 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPATO15228 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPATO15228 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPATO15228 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPATO15228 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPATO15228 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPATO15228 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPATO15228 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPATO15228 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPATO15228 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPATO15228 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPATO15228 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPATO15228 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPATO15228 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms