Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms