Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELL2O00472 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL2O00472 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL2O00472 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms