Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
O00370 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
O00370 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
O00370 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
O00370 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms