Protein–RNA interactions for Protein: G3V0Z9

LYNX1, HCG2043033, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1G3V0Z9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYNX1G3V0Z9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms