Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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