Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms