Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms