Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
SSPOA2VEC9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms