Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARFGEF2Q9Y6D5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms