Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms