Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms