Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC9A8Q9Y2E8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC9A8Q9Y2E8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms