Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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USP18Q9UMW8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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USP18Q9UMW8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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