Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms