Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUF60Q9UHX1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms