Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms