Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms