Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms