Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms