Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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