Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms