Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms