Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COMMD8Q9NX08 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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