Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms