Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SALL1Q9NSC2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms