Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC31BQ9NQW1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms