Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms