Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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