Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBPF3Q9H094 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms