Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms