Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms