Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms