Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms