Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms