Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms