Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms