Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms