Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms